已發現的能用于生物濕法冶金的微生物有20余種，分別屬于硫桿菌屬(Thiobacillus),鐵桿菌屬(Ferrobacillus)嗜酸嗜熱的硫葉菌屬( Sulfolobus)和異養菌、真菌及醉母菌。現在用于工業上預氧化金礦石的細菌主要有四種，氧化鐵硫桿菌( Thiobacillus Ferrooxdans,T. f) ,氧化硫硫桿菌(Thiobacillus Thiooxidans, T. t )、氧化鐵鐵桿菌(Ferrobacillus Ferroxidans , F. f )、氧化硫鐵桿菌( Ferrobacillus Sulfooxidans, F. s )。優良菌種的獲取是微生物技術的核心。這些細菌主要生長在金屬硫化礦床和煤炭礦床的酸性礦水中，經過分離、篩選及馴化等培養步驟，可用于金屬提取的濕法冶金中。
