生物氧化預處理體系是一個由液、固、氣、生物組成的四相體系。在這個體系中，液體(主要是水及溶解其中的各種離子)是四相體系存在的媒介，固體是細菌氧化作用的對象，氣體中的氧氣和二氧化碳是細菌生長的必需條件，生物(細菌)則是生物氧化預處理的主體。該體系中的各相相互依存和作用，缺一不可，構成了生物氧化預處理體系。

生物氧化預處理體系是一種特殊的體系，在該體系中，由于有生命的生物存在，在一般的化學反應中對浸出有益的溫度條件，在此則成為生物氧化的控制因素。另外，在化學浸出中并非嚴格的濃度、pH值、充氣量等也由于生物氧化的原因而成為必須嚴格控制的因素。

在生物氧化預處理體系中，由于各相的作用不同，其在體系中的停留時間也不同。固相的停留時間取決于其中目的礦物被合適氧化所需的時間;液相的停留時間與其在體系中的循環次數有關;氣相的停留時間與其壓力、在體系中的分散方式、固相在體系中的含量等因素有關;生物相則由于是整個體系的主體，與另外三相有著緊密的聯系，其停留時間與其自身的繁殖速度、固相中所需氧化的目的礦物的含量、細菌戮附到所需氧化目的礦物表面的時間、體系中有害物質的含量、營養劑的種類及添加量、體系的溫度、pH值、電位Eh、體系的進出流量、反應器的流體動力學性能等多種因素均密切相關。

生物氧化預處理體系的作用是將包裹目的礦物的非目的礦物組分進行氧化分解，使目的礦物裸露出來，以便于下一步提取處理。

本章僅就礦物晶體結構、生物氧化體系溫度、充氣量、溶氧量、二氧化碳含量、礦漿中固體含量、固體顆粒粒徑、溶液中的剪切強度和有害離子等物理化學因素與生物氧化體系的關系進行研究。