從上面的討論可知，需氧礦質化能自養菌的特性決定了它們可以氧化含有Fee+或還原硫(包括硫化物、二硫化物及砷硫化物)的礦物。此外，被氧化的礦物的氧化產物(如Fe3+或硫酸)可以用來溶解同時存在于礦石中的次級礦物，從而使得那些能被酸或Fe3+溶解，或能被兩者的反應劑溶解，但不含Fe2+也不含還原硫的礦物也有可能被生物氧化處理。在這種情況下，被氧化的礦物中需要存在或加人足夠量的黃鐵礦或一種可替代的含Fee+及硫的礦物。因此，生物氧化工藝基本可以分為金屬解離氧化工藝、原生礦物氧化工藝和次生礦物氧化工藝3種類型。

(1)金屬解離氧化工藝。采用細菌對載體礦物進行氧化，使其中被包裹的有價元紊裸露出來，易于下一步作業回收。如對包裹金(或銀)的各種載體礦物進行氧化及溶解的過程，使其中的金(或銀)解離出來易于回收。

(2)原生礦物氧化工藝。采用細菌對原生硫化礦物氧化及溶解的過程，使其中的金屬組分被回收。如黃銅礦、硫鉆礦、閃鋅礦等的生物浸出則為原生礦物的氧化。幾

(3)次生礦物溶解工藝。采用細菌對次生礦物(氧化物及碳酸鹽)氧化及溶解，通過對黃鐵礦，或是類似的含鐵及含硫的礦物的初級氧化以提供可以溶解金屬的Fe3+及硫酸溶液。如對鈾礦中鈾的回收，即是通過鈾礦中存在的(或加人的)黃鐵礦被細菌氧化產生硫酸及Fe3+，然后，硫酸溶解含鈾酞離子的礦物，Fe3十使鈾的氧化物氧化(U4+氧化為U6+ )，使其易于回收。