細菌在長期的進化過程中，形成了一套嚴密、精確、靈敏的代謝調節體系。細菌的新陳代謝過程錯綜復雜，參與代謝的物質也多種多樣，即使同一種物質也會有不同的代謝途徑，但細菌的代謝調節體系能夠嚴格地控制代謝活動，使其有序而高效地運行，并能靈活地適應外界環境，關鍵在于其體內的調節蛋白(Regulatory proteins)和代謝酶(Metabolic enzymes)。當外界的環境發生變化時，通過調節蛋白調節控制代謝酶的合成速度，從而控制細菌的代謝速度以適應外界環境的變化。
在細菌氧化過程中，隨著礦漿中硫化礦物成分的變化，細菌會通過自身的代謝調節體系不斷地調節代謝功能以適應氧化環境的變化。
